中国农科院农业资源与农业区划研究所设有中国农科院食用菌工程技术研究中心（部级中心）、农业部国家食用菌标准菌株库、农业部食用菌区试组、农业部微生物肥料和食用菌菌种质量监督检验测试中心（双认证）、中国农业微生物菌种保藏管理中心。
     专用主要设备设施有：隔氮式液氮冻存系统、无菌操作系统、多功能系统显微镜、高速冷冻离心机、梯度PCR仪、凝胶成像系统、低温培养箱、人工气候箱、菇房环境自控系统、蛋白质自动测定仪、高效液相色谱仪、气相色谱仪、原子荧光光度计、原子吸收光度计、脉冲电泳仪等。
     技术平台有：国家食用菌产业技术研发中心，内设全国食用菌产业与技术的基础数据库；国家食用菌改良中心，种质评价和创新研究的系列设备设施；国家食用菌标准菌株库，应用超低温液氮保藏设施，保藏国内外优异种质1800多株，野生种质资源4000余株；农业部微生物肥料和食用菌菌种质量监督检验测试中心，负责全国食用菌菌种质量检验检测；中国农科院食用菌工程技术研究中心，在不同生态区域下设产业化技术研发集成示范基地。

        “十五”以来承担和完成的省级以上科技项目

      “十五”以来承担和完成科技部平台项目、科技部支撑项目、科技部“973”项目、科技部“863”项目、农业部国际农业先进技术引进项目、农业部公益性行业科研项目、农业部产业结构调整项目、农业部标准化项目、北京市科委重大和重点项目、天津市重点项目等33项。